Gene Enrichment Profiler

Tissue/Cell	Sub Tissues/Cells	Number of arrays	References
ES cells		3	PMID:17417652
stem cells	HSC fetal blood CD34+ CD38-	3	GEO:GSE3823
	HSC cord blood CD34+ CD38-	3	GEO:GSE3823
	HSC cord blood CD34+ CD38- CD33-	5	GEO:GSE2666
	HSC bone marrow CD34+ CD38- CD33-	4	GEO:GSE2666
	HSC fetal blood CD34+ CD38+	3	GEO:GSE3823
	HSC cord blood CD34+ CD38+	3	GEO:GSE3823
	HSC cord blood CD34+ CD38+ CD33-	5	GEO:GSE2666
	HSC periph blood CD34+ CD38+	3	GEO:GSE3823
	HSC bone marrow CD34+ CD38+	3	GEO:GSE3823
	HSC bone marrow CD34+ CD38+ CD33-	4	GEO:GSE2666
	Bone marrow CD34+	8	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096, GEO:GSE3823
B cells	B cells cord blood CD34+	2	PMID:14634063
	B cells Pro	1	PMID:16237084
	B cells PreI	3	PMID:16237084
	B cells PreII	5	PMID:16237084
	B cells immature	3	PMID:16237084
	B cells CD19+	4	GNF(PMID:15075390), PMID:15210760,16339519
	Tonsils	12	GNF(PMID:15075390), GEO:GSE2665
	Lymph node	12	GNF(PMID:15075390), GEO:GSE2665
T cells	Thymus	5	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096, GEO:GSE1460
	T cells cord blood CD34+	2	PMID:14634063
	Thymic CD34+	2	PMID:15928199
	Thymic CD34+CD38+ CD1A-	4	PMID:15928199
	Thymic CD34+CD38+ CD1A+	2	PMID:15928199
	Thymic CD4+CD8-CD3-	5	PMID:15928199, GEO:GSE1460
	Thymic CD4+CD8+CD3-	2	PMID:15928199
	Thymic CD4+CD8+CD3	4	PMID:15928199, GEO:GSE1460
	Thymic SP CD4+ T cells	5	PMID:15928199, GEO:GSE1460
	Peripheral naive CD4+ T cells	14	GNF(PMID:15075390), GEO:GSE2770, GEO:GSE1460, ArrayExpress:E-MEXP750
	Th1	4	GEO:GSE2770, PMID:15210760,16339519
	Th2	4	GEO:GSE2770, PMID:15210760,16339519
	Thymic SP CD8+ T cells	2	PMID:15928199
	Peripheral CD8+ T cells	7	GNF(PMID:15075390), GEO:GSE6740
	Tonsils CD4+ T cells	5	PMID:15210760,16339519
	T cells BAFF+	2	PMID:15210760,16339519
	T cells CD57+	3	PMID:15210760,16339519
	T cells central memory	7	PMID:15210760,16339519, ArrayExpress:E-MEXP750
	T cells effector memory	4	PMID:15210760,16339519, ArrayExpress:E-MEXP750
	T cells gammadelta	2	PMID:15210760,16339519
	Treg	2	GEO:GSE4527
	NK CD56+	2	GNF(PMID:15075390)
Myeloid	DC Immature	5	PMID:15210760,16339519, GEO:GSE9946
	DC LPS 6h	2	PMID:15210760,16339519
	DC LPS 48h	2	PMID:15210760,16339519
	DC	7	GNF(PMID:15075390), PMID:15210760,16339519, GEO:GSE9946
	DC BAFF+	2	PMID:15210760,16339519
	Myeloid CD33+	12	GNF(PMID:15075390), GEO:GSE10325
	Monocyte CD14+	15	GNF(PMID:15075390), GEO:GSE10612, GEO:GSE8515, GEO:GSE8286
	Derived Macrophage 16h	3	GEO:GSE8286
	Macrophage	5	PMID:15210760,16339519, GEO:GSE8286
	Macrophage LPS 4h	2	PMID:15210760,16339519
	Mast cell	2	PMID:15210760,16339519
	Mast cell IgE	2	PMID:15210760,16339519
	Spleen	4	GEO:GDS1096, GEO:GSE2004
	Blood	2	GNF(PMID:15075390)
	Neutrophils	2	PMID:15210760,16339519
	RBC	2	GNF(PMID:15075390)
CNS	Whole brain	14	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096, GEO:GSE2361, GEO:GSE5389
	Fetal brain	3	GEO:GDS1096, GNF(PMID:15075390)
	Frontal cortex	6	GEO:GSE3790
	Prefrontal cortex	2	GNF(PMID:15075390)
	Parietal Lobe	2	GNF(PMID:15075390)
	Occipital lobe	2	GNF(PMID:15075390)
	Temporal lobe	2	GNF(PMID:15075390)
	Cingulate cortex	2	GNF(PMID:15075390)
	Caudate nucleus	14	GNF(PMID:15075390), GEO:GSE3790, GEO:GDS1096
	Globus pallidus	2	GNF(PMID:15075390)
	Thalamus	3	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096
	Subthalamic nucleus	2	GNF(PMID:15075390)
	Hypothalamus	2	GNF(PMID:15075390)
	Hippocampus	9	GEO:GDS1096, GEO:GSE1297, GEO:GDS1297
	Amygdala	3	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096
	Cerebellum	9	GNF(PMID:15075390), GEO:GSE3790, GEO:GDS1096
	Cerebellum peduncles	2	GNF(PMID:15075390)
	Pons	2	GNF(PMID:15075390)
	Medulla oblongata	2	GNF(PMID:15075390)
	Spinal cord	3	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096
	Olfactory bulb	2	GNF(PMID:15075390)
	Trigeminal ganglion	2	GNF(PMID:15075390)
	Ciliary ganglion	2	GNF(PMID:15075390)
	Dorsal root ganglion	2	GNF(PMID:15075390)
	Superior cervical ganglion	2	GNF(PMID:15075390)
	Adrenal gland	5	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096
	Pituitary	3	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096
Thyroid	Thyroid	3	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096
	Fetal thyroid	2	GNF(PMID:15075390)
Pancreas		3	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096
Muscle	Skeletal muscle	20	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096, GEO:GSE1462, GEO:GSE6011
	Tongue	2	GNF(PMID:15075390)
	Smooth muscle	5	GNF(PMID:15075390), GEO:GSE3356
Heart	Cardiac myocytes	2	GNF(PMID:15075390)
	Cardiac muscle left ventricle	5	GEO:GSE2240
	Heart	3	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096
	Atrioventricular node	2	GNF(PMID:15075390)
Islet Cells		2	GNF(PMID:15075390)
Kidney		11	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096, GEO:GSE781, GEO:GSE2004
Bladder		10	GEO:GDS1096, GEO:GSE3167
Liver	Liver	6	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096, GEO:GSE2004
	Fetal liver	3	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096
Adipose	Preadipocyte subcutanous	3	GEO:GSE1657
	Adipocyte	10	GNF(PMID:15075390), GEO:GSE5090
Airway	Lung	18	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096, GEO:GSE10072
	Fetal Lung	3	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096
	Broncho epithelial	2	GNF(PMID:15075390)
	Trachea	3	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096
Placenta		3	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096
Skin		7	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096, GEO:GSE5667
Endothelial CD105+		2	GNF(PMID:15075390)
Salivary Gland		3	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096
Esophagus		8	GEO:GDS1321
Stomach		1	GEO:GDS1096
SmallIntestine		17	GEO:GDS1096, ArrayExpress:E-MEXP-941
Appendix		2	GNF(PMID:15075390)
Colon		14	GEO:GDS1096, ArrayExpress:E-MTAB-57
Ovary		3	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096
Uterus	Uterus	3	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096
	Uterus corpus	3	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096
Breast		4	GEO:GDS1096, GEO:GSE6883
Testis	Testis	3	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096
	Testis Leydig cell	2	GNF(PMID:15075390)
	Testis germ cell	2	GNF(PMID:15075390)
	Testis intersitial	2	GNF(PMID:15075390)
	Testis seminiferous tubule	2	GNF(PMID:15075390)
	Prostate	3	GNF(PMID:15075390), GEO:GDS1096
Conjunctiva		4	GEO:GSE2513