Gene Enrichment Profiler

Mapping of probe set AFFX-ThrX-3_at to genomic DNA


Probes matching to Affy annotated chromosome using BLAT (2 mismatches allowed):

Mapping to chr1
Probe name Start End Strand Match Gene match (UCSC ID, Symbol, Exons) Notes
AFFX-ThrX-3_at_1            
AFFX-ThrX-3_at_2            
AFFX-ThrX-3_at_3            
AFFX-ThrX-3_at_4            
AFFX-ThrX-3_at_5            
AFFX-ThrX-3_at_6            
AFFX-ThrX-3_at_7 227738619 227739038 - 25/25
uc001htp.2 ABCB10 in intron
This probe is not considered a match. Chr gap bases = 394
AFFX-ThrX-3_at_8            
AFFX-ThrX-3_at_9            
AFFX-ThrX-3_at_10            
AFFX-ThrX-3_at_11            
AFFX-ThrX-3_at_12            
AFFX-ThrX-3_at_13            
AFFX-ThrX-3_at_14            
AFFX-ThrX-3_at_15            
AFFX-ThrX-3_at_16            
AFFX-ThrX-3_at_17            
AFFX-ThrX-3_at_18            
AFFX-ThrX-3_at_19            
AFFX-ThrX-3_at_20            

Mapping to chr2
Probe name Start End Strand Match Gene match (UCSC ID, Symbol, Exons) Notes
AFFX-ThrX-3_at_1            
AFFX-ThrX-3_at_2            
AFFX-ThrX-3_at_3            
AFFX-ThrX-3_at_4            
AFFX-ThrX-3_at_5            
AFFX-ThrX-3_at_6            
AFFX-ThrX-3_at_7 181217065 181217188 - 25/25   This probe is not considered a match. Chr gap bases = 98
AFFX-ThrX-3_at_8            
AFFX-ThrX-3_at_9            
AFFX-ThrX-3_at_10            
AFFX-ThrX-3_at_11            
AFFX-ThrX-3_at_12            
AFFX-ThrX-3_at_13            
AFFX-ThrX-3_at_14            
AFFX-ThrX-3_at_15            
AFFX-ThrX-3_at_16            
AFFX-ThrX-3_at_17            
AFFX-ThrX-3_at_18            
AFFX-ThrX-3_at_19            
AFFX-ThrX-3_at_20            

Mapping to chr3
Probe name Start End Strand Match Gene match (UCSC ID, Symbol, Exons) Notes
AFFX-ThrX-3_at_1            
AFFX-ThrX-3_at_2            
AFFX-ThrX-3_at_3            
AFFX-ThrX-3_at_4            
AFFX-ThrX-3_at_5            
AFFX-ThrX-3_at_6            
AFFX-ThrX-3_at_7 13163994 13164401 + 25/25   This probe is not considered a match. Chr gap bases = 382
AFFX-ThrX-3_at_8            
AFFX-ThrX-3_at_9            
AFFX-ThrX-3_at_10            
AFFX-ThrX-3_at_11            
AFFX-ThrX-3_at_12            
AFFX-ThrX-3_at_13            
AFFX-ThrX-3_at_14            
AFFX-ThrX-3_at_15            
AFFX-ThrX-3_at_16            
AFFX-ThrX-3_at_17            
AFFX-ThrX-3_at_18            
AFFX-ThrX-3_at_19            
AFFX-ThrX-3_at_20            

Mapping to chr5
Probe name Start End Strand Match Gene match (UCSC ID, Symbol, Exons) Notes
AFFX-ThrX-3_at_1            
AFFX-ThrX-3_at_2            
AFFX-ThrX-3_at_3            
AFFX-ThrX-3_at_4            
AFFX-ThrX-3_at_5            
AFFX-ThrX-3_at_6            
AFFX-ThrX-3_at_7 161530011 161530134 - 25/25   This probe is not considered a match. Chr gap bases = 98
AFFX-ThrX-3_at_8            
AFFX-ThrX-3_at_9            
AFFX-ThrX-3_at_10            
AFFX-ThrX-3_at_11            
AFFX-ThrX-3_at_12            
AFFX-ThrX-3_at_13            
AFFX-ThrX-3_at_14            
AFFX-ThrX-3_at_15            
AFFX-ThrX-3_at_16            
AFFX-ThrX-3_at_17            
AFFX-ThrX-3_at_18            
AFFX-ThrX-3_at_19            
AFFX-ThrX-3_at_20            

Mapping to chr7
Probe name Start End Strand Match Gene match (UCSC ID, Symbol, Exons) Notes
AFFX-ThrX-3_at_1            
AFFX-ThrX-3_at_2            
AFFX-ThrX-3_at_3            
AFFX-ThrX-3_at_4            
AFFX-ThrX-3_at_5            
AFFX-ThrX-3_at_6            
AFFX-ThrX-3_at_7 156975596 156976004 + 25/25   This probe is not considered a match. Chr gap bases = 383
AFFX-ThrX-3_at_8            
AFFX-ThrX-3_at_9            
AFFX-ThrX-3_at_10            
AFFX-ThrX-3_at_11            
AFFX-ThrX-3_at_12            
AFFX-ThrX-3_at_13            
AFFX-ThrX-3_at_14            
AFFX-ThrX-3_at_15            
AFFX-ThrX-3_at_16            
AFFX-ThrX-3_at_17            
AFFX-ThrX-3_at_18            
AFFX-ThrX-3_at_19            
AFFX-ThrX-3_at_20            

Mapping to chr10
Probe name Start End Strand Match Gene match (UCSC ID, Symbol, Exons) Notes
AFFX-ThrX-3_at_1            
AFFX-ThrX-3_at_2            
AFFX-ThrX-3_at_3            
AFFX-ThrX-3_at_4            
AFFX-ThrX-3_at_5            
AFFX-ThrX-3_at_6            
AFFX-ThrX-3_at_7 13494153 13494600 + 25/25   This probe is not considered a match. Chr gap bases = 422
AFFX-ThrX-3_at_8            
AFFX-ThrX-3_at_9            
AFFX-ThrX-3_at_10            
AFFX-ThrX-3_at_11            
AFFX-ThrX-3_at_12            
AFFX-ThrX-3_at_13            
AFFX-ThrX-3_at_14            
AFFX-ThrX-3_at_15            
AFFX-ThrX-3_at_16            
AFFX-ThrX-3_at_17            
AFFX-ThrX-3_at_18            
AFFX-ThrX-3_at_19            
AFFX-ThrX-3_at_20